Ferenc Xavér Haller nacque a Varasd il 22 dicembre 1716. Entrò nell’ordine dei gesuiti nel 1733; secondo le fonti, o il 27 ottobre a Trenčín, oppure il 3 novembre a Vienna. Svolse il noviziato a Vienna. Nel 1736 studiò alla scuola magistrale di Zagabria, dal 1737 a Graz studiò logica, metafisica e fisica, poi studiò e insegnò a Zagabria, Varasd, Graz e Vienna. Tra il 1744 e il 1747 si laureò in teologia a Nagyszombat, nel 1748 trascorse il terzo anno di noviziato a Besztercebánya e nel 1749-1750 insegnò matematica a Lubiana.

Le fonti successive lo hanno spesso confuso con il gesuita József Haller, oltre ad aver frainteso l’indicazione “Quito”. Ferenc Xavér Haller non fu coinvolto nei preparativi della spedizione al confine tra Spagna e Portogallo semplicemente come missionario di Quito, ma come gesuita scienziato, grazie alle sue conoscenze matematiche e astronomiche. Nel 1754 giunse a Cumaná, per poi operare nella regione dell’Orinoco-Guayana. Nel maggio del 1755, o il 24 giugno, morì a causa di una malattia febbrile tropicale, in un luogo a metà strada tra Trinidad e Guayana.